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武举考试后，新进的武进士进入讲武堂，另编一班，名曰进士班。两边泾渭分明，彼此之间不大往来。这正是孙传庭想要的结果，只有平衡才是长远之计，军官全部来自一个地方，会使得军队中近卫军势力太大，这是很多人都不想看到的情况。
武举后进行的是科举考试，之所以提前这么久，是要方便有些人落榜后可以进行京师大学堂的招生考试，叶向高为主考，孙传庭为副主考，共录取了进士同进士两百一十三人，其中状元余煌，榜眼华琪芳，探花吴孔嘉。
发榜之日，众考生的样子可比三年前要平静多了。东厂来报，没有考上的痛哭的少了，榜下捉婿的也少了，考上以后欢呼雀跃的倒还是一样，但周围羡慕嫉妒的眼神少了很多。
朱由校很是高兴，这说明随着京师大学堂的开办，士子们有了更多的上升渠道，大家不会再一起挤科举这个独木桥了。他知道，一个国家里阶层固化是最大的问题，必须让各阶层都知道，自己可以上升到更高的阶层，这样的国家才会有活力。现在看来，自己的办学在这个方面倒是起到了很好的作用。
天启五年初，京师大学堂的招生考试终于开始了。因为招生人数多，而且参考资格低，所以其热闹程度超过了科举考试。
师范学堂和吏员学堂招生依旧如以前一样，都是招收了一千二百名，研究院依旧是六百人，国文院招收了三百人。吏员学堂下面专门设立了一个法学院，专门招收法律学员，共招了六百人，院长是大理寺卿吴仁度。
翰林院已经按照皇帝的要求将《大明律》修缮完成，这个工作量并不大，只是在刑罚世轻世重方面，以及执法机关的改变方面，还有刑罚的类型方面进行了修改。
刑罚时轻时重全部废除，执法机关变成了大理寺及下属的各级法院，刑部只拥有侦查逮捕之权。刑罚的类型废除了枷号刑，但充军依旧保留，而且加入了充军四千里以上的刑罚，这是为了开拓新殖民地做准备。其余的笞、杖、徒、流、死刑依然保留，但规定除非谋逆，死刑都采用绞刑，以留全尸。
朱由校本来想把剐刑废除掉，但得到了大臣们的一致反对。大家都认为，即使不用，将这个刑罚列在《大明律》中，也是有威慑作用的。
而在《大明律》的修缮中，最让大臣们满意的一点就是不论是东厂还是锦衣卫，廉政公署还是经济调查局，都和刑部一样只具有调查逮捕之权，这让魏忠贤非常不满意，在朱由校面前抱怨了几次，搞得朱由校很不耐烦，最后只好骂道：“你们抓了个人，问出了他的罪证，难道大理寺还敢为他开脱吗？再说，有些人你想让他死在诏狱中，那还不是一句话的事。”
魏忠贤眉开眼笑道：“圣上这么说奴婢就明白了，只要圣上想让谁死，那谁就一定得死。”
朱由校点了点头道：“厂臣，你这一点很让朕满意，即便你想要谁死，也要先告诉我，由我来决定，人命关天，不要让它成为别人攻击你的借口。”
魏忠贤赶紧道：“那当然是圣天子断人生死，奴婢万万不敢自作主张。”
天启五年二月初二，京师大学堂正式开学了。朱由校前往法学院，要进行开学演讲。
法学院的礼堂（其实就是餐室）里已经坐满了新招的法律学员。见到皇帝和阁臣时，大家便要跪下行礼，被维持秩序的锦衣卫制止了。在锦衣卫的提示下，大家一起躬身作揖。
朱由校来到台上，等吴仁度宣布由皇帝陛下讲话时，来到了喇叭前道：“各位学员，朕是大明皇帝，也是京师大学堂的山长。在京师大学堂中，大家见到朕是不用行跪拜礼的，这一点以后要记住。”
“今天朕非常高兴，在各位大臣的努力下，我们的法学院终于成立了。以后全国各府州县，都会有专业的断案人员，那就是你们。”
“朕今天有几点要说的，第一点就是，法律是刚性的，是朝廷意志的体现，是不容违反的。以往的案件中，我们首先考虑的是情和理，然后才是法。这不行，有一句话叫法不容情，法律是冰冷的，是就是是，不是就是不是，没有什么情理可言。我们日后当上了法官，必须记住这一点，大明的法律在没有修改之前，是一定要按法办案的。朕简单地归结为这么几个字：有法可依，这是制定法律的事，有法必依，执法必严，违法必究，这就是你们的事。至于考虑法律之外的情与理的事，那是朕的事。”
“第二个要强调的是，法律是干什么的？法律是管谁的？我们一直都认为，法律是用来管老百姓的，这对不对呢？朕觉得，对也不对，老百姓也会触犯法律，那法律就会管这批人，而法律其实最重要的是保障老百姓的权力，不让官吏侵吞老百姓的利益。我大明法律在这一个方面是做得比较好的，每年被抓的官员人数虽然比不上老百姓，但如果从比例上来看，是远远高于老百姓的。”
“我国有句古话，王子犯法，与庶民同罪。这句话流传极广，但做得如何呢？古代有强项令，他的故事一直在今天都还有人在传颂。那是不是说我国就做到了这一点呢？朕觉得不是，因为之所以强项令的故事可以流传千年，便是因为这样的人，这样的事太少，因为稀少所以显得珍贵。朕提出一个口号，法律面前，人人平等。包括朕，朕也必须遵守法律。朕如果违反了法律，也要接受法律的审判。”
坐在下面的学员们面色奇怪地看着皇帝，慢慢地开始有人小声谈论起来。而朱由校身后的大臣们面色肃然，虽然限制皇帝的权力是他们的理想，但皇帝突然说自己也要接受法律的审判，让他们一时不知如何是好。